2. 青岛海洋科学与技术国家实验室 海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室 青岛 266071;
3. 上海海洋大学 上海 201306;
4. 青岛瑞滋海珍品发展有限公司 青岛 266000
2. Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Laboratory for Marine Fisheries Science and Food Production Processes, Qingdao 266071;
3. Shanghai Ocean University, Shanghai 201306;
4. Qingdao Ruizi Seafood Development Co., Ltd, Qingdao 266400
刺参(Apostichopus japonicus)具有很高的药用和营养保健价值,被称为“海产八珍”之首(廖玉麟, 1997)。海参增养殖产业迅猛发展,目前,已形成以山东、辽宁、河北沿海为主产区、以“北参南养”和“东参西养”等模式延伸到福建、浙江沿海和以黄河三角洲地区为代表的刺参增养殖产业群,年产量达19.37万t、养殖面积达21万hm2,产值约200亿元(王印庚等, 2014)。然而,随着产业规模的急剧扩大,养殖刺参出现了生长缓慢、抗逆能力下降等种质退化现象,亟需开展刺参良种的选育工作。
水产动物的大多数经济性状属于数量性状。遗传参数反映数量性状的基本遗传规律,解析数量性状的遗传参数,对水产动物养殖生产中良种生产性能的保持、重要经济性能的提高和新品种的培育等具有重要的指导意义(陈国宏等, 2009)。国内外在遗传参数研究方面涉及的水产动物品种涵盖了鱼、贝、虾和蟹(唐瞻杨等, 2015; Frizzas et al, 2009; Sun et al, 2015)。国内刺参遗传参数的研究主要集中在耳状幼体(浮游幼体期)及3–4月龄稚参培育期(李云峰等, 2009;栾生等, 2006;孟思远等, 2010),对于幼参培育期刺参经济性状遗传力的研究尚未有报道。对于刺参而言,在不同的生长发育阶段生物经济性状的遗传力不同,其浮游幼体期个体小,除体长性状外,其余性状均难以测量;稚参培育期,部分性状尚未完全表征且耳状幼体期及3–4月龄的稚参培育期均存在母性效应(栾生等, 2006;孟思远等, 2010) 使遗传力估计值准确度偏低。因此,开展大规格刺参苗种的经济性状遗传力研究具有更重要的现实意义。
经济性状测量的准确性是遗传力精确评估的前提,鉴于刺参特殊的生理生活习性,目前,可精确测定的经济性状主要有体长、体重和肉刺总数,并建立了相关测量方法(魏杰等, 2007;廖梅杰等, 2011; Chang et al, 2011)。特别提出的是刺参的市场价格与刺型(肉刺总数)密切相关,往往多刺型刺参产品的价格是寡刺型的一倍以上。本研究参照刺参性状精确测量的方法与要求,以课题组前期收集、保存的刺参群体为亲本,以6头雌性刺参为母本,23头雄性刺参为父本,构建了全同胞和半同胞家系,并以此对9月龄的大规格刺参苗种体长、体重以及肉刺总数3个经济性状进行测量以及遗传力评估,解析了大规格苗种的经济性状遗传参数,以期为刺参良种选育提供基础数据。
1 材料与方法 1.1 材料实验所用亲参为本课题组前期收集、保存的刺参群体,亲参种群存放于种参养殖池(6 m×16 m)内,采取升温促熟的方式进行亲参培育。待性腺发育成熟后,自亲参种群中选取健康、活力强的个体作为亲本,进行苗种繁育和家系构建。
1.2 方法 1.2.1 家系建立2014年3月29日,待亲参性腺发育成熟后,每个群体选择20头,每个个体单独放入30 L的塑料水槽,阴干30 min、21℃海水流水刺激,选择可成功产卵或排精的亲参个体共29头(6雌23雄),对刺参产卵量计数后量取每头雌参约2×105粒卵子和适量精液,同时放入新的水槽中进行人工授精,按照每头雌参配2–5头雄参的原则,构建了6个母系半同胞家系和23个全同胞家系。
1.2.2 苗种培育将家系配伍形成的受精卵转入400 L(80 cm×80 cm×60 cm)的白色塑料水槽中培育,孵化水温为22–23℃,光照为500–1000 lx,持续微量充气,在孵化过程中每隔1 h搅动1次,使受精卵处于悬浮状态。在受精卵发育到浮游幼体时进行布苗,布苗密度为0.5个/ml,待幼体变态附板后转入2.5 m× 1.2 m×1.5 m的长方形水泥培育池中进行培育。对刺参家系进行单独培育,保证培育过程中环境条件(养殖水体体积、养殖用水的盐度和温度、光照、充气、饵料等)的一致性,并分别在浮游幼体期、3月龄、6月龄进行养殖密度的均一化,使所有家系维持在相同的密度进行养殖管理。苗种培育过程中所用的饵料在浮游期以盐藻(Dunaliella salina)、角毛藻(Chaetoceros sp.)等单胞藻和海洋红酵母为主,后期以发酵饲料为主。海参饲料由海带(Saccharina japonica)、石莼(Ulva lactuca)、扇贝边、马尾藻(Scagassum sp.)、豆粕、贝壳、海泥等主要成分构成的粉末饲料,加入酵母发酵24 h后投喂。每天换水1/3,其他按照刺参苗种培育过程进行正常管理。
1.2.3 性状测量在9月龄时,分别从每个家系中随机抽取刺参30头进行体长、体重测量,取50头用于肉刺总数计数。体长、体重测量过程中,用0.6 mol/L的MgSO4溶液浸泡参苗,待参苗麻醉后,用圆规标定参苗长度后再用游标卡尺测量其体长,精确到0.01 cm;用电子天平测量其体重,精确到0.01 g,并记录每个刺参的肉刺总数(魏杰等, 2007;廖梅杰等, 2011)。
1.2.4 数据处理对于相关性状的方差分析(ANOVA)通过IBM SPSS 22.0的GLM (General Line Model)过程实现,在二因素系统分组设计下,刺参相关性状的表型和遗传参数的估计采用数学模型为:
$ {{X}_{ijk}}=u+{{S}_{i}}+{{d}_{ij}}+{{e}_{ijk}} $ | (1) |
式中,
表中,N为测量后代总数,S为刺参父本数目,D为刺参母本数目;σs2为父系半同胞方差;σd2为母系半同胞方差;σe2为全同胞个体间方差。
对于巢式不平衡设计,为保证参数计算的准确性,在进行遗传力估计之前需要对每个雄性亲本的后代数、每个雌性亲本的后代数和雌性亲本内与配的雄性亲本平均后代数进行加权校正,具体计算方法如下:
$ {{K}_{1}}=\frac{1}{S-D}\left(N-\sum\limits_{i=1}^{d}{\sum\limits_{j=1}^{{{s}_{i}}}{\frac{N_{ij}^{2}}{{{N}_{i}}_{.}}}} \right) $ | (2) |
$ {{K}_{2}}=\frac{1}{D-1}\left(\sum\limits_{i=1}^{d}{\sum\limits_{j=1}^{{{s}_{i}}}{\frac{N_{ij}^{2}}{{{N}_{i.}}}}}-\sum\limits_{i=1}^{d}{\sum\limits_{j=1}^{{{s}_{i}}}{\frac{N_{ij}^{2}}{N}}} \right) $ | (3) |
$ {{K}_{3}}=\frac{1}{D-1}\left(N-\frac{1}{N}\sum\limits_{i=1}^{d}{N{{_{i}^{2}}_{.}}} \right) $ | (4) |
式中,
根据巢式遗传设计方差分析结果与期望均方联立方程求得各组分方差分析得到父系半同胞、母系半同胞和全同胞3个遗传力估计值(盛志廉等, 2001),半同胞狭义遗传力估计值为半同胞组内相关系数的4倍,全同胞估计的狭义遗传力为全同胞组内相关系数的2倍,即:
$ \text{父系半同胞:}\ \ h_{s}^{2}=4\times \frac{\sigma _{s}^{2}}{\sigma _{s}^{2}+\sigma _{d}^{2}+\sigma _{e}^{2}} $ | (5) |
$ \text{母系半同胞:}\ h_{d}^{2}=4\times \frac{\sigma _{d}^{2}}{\sigma _{s}^{2}+\sigma _{d}^{2}+\sigma _{e}^{2}} $ | (6) |
$ \text{全同胞:}\ h_{sd}^{2}=2\times \frac{\sigma _{s}^{2}+\sigma _{d}^{2}}{\sigma _{s}^{2}+\sigma _{d}^{2}+\sigma _{e}^{2}} $ | (7) |
式中,
为检测所估计的遗传力的准确性,需要对其进行显著性检验。采用盛志廉等(2001) 所推荐的t检验对全同胞资料遗传力估计值的显著性进行评价,检验原则为以被检测的统计量除以它的标准误后,再依据t分布临界值表进行判断。相应检验方法为:
(1) 雌性组分遗传力估计值(
$ A=\sqrt{\frac{1}{K_{3}^{2}}\left(\frac{MS_{s}^{2}}{d{{f}_{s}}}+\frac{MS_{d}^{2}}{d{{f}_{d}}} \right)} $ | (8) |
$ \sigma (h_{d}^{2})\approx \frac{4}{\sigma _{p}^{2}}\times A $ | (9) |
$ t=\frac{h_{d}^{2}}{\sigma (h_{d}^{2})} $ | (10) |
(2) 雄性组分遗传力估计值(
$ B=\sqrt{\frac{1}{K_{1}^{2}}\left(\frac{MS_{s}^{2}}{d{{f}_{s}}}+\frac{MS_{e}^{2}}{d{{f}_{e}}} \right)} $ | (11) |
$ \sigma (h_{s}^{2})\frac{4}{\sigma _{p}^{2}}\times B $ | (12) |
$ t=\frac{h_{s}^{2}}{\sigma (h_{s}^{2})} $ | (13) |
(3) 雌雄组分合并估计值(
$ C=-\frac{{{K}_{1}}}{{{K}_{3}}}\left({{B}^{2}}-\frac{2MS_{e}^{2}}{K_{1}^{2}d{{f}_{e}}} \right) $ | (14) |
$ \sigma (h_{sd}^{2})\frac{2}{\sigma _{p}^{2}}\times \sqrt{({{A}^{2}}+{{B}^{2}}+2C)} $ | (15) |
$ t=\frac{h_{sd}^{2}}{\sigma (h_{sd}^{2})} $ | (16) |
由所测体长、体重和肉刺总数3个性状数据资料所计算出的9月龄刺参经济性状的平均值和标准差(Mean±SD)见表 2。从表 2可以看出,9月龄所有刺参体长平均值为(4.66±0.06) cm,体重的平均值为(4.75±0.19) g,肉刺总数平均值为(40.32±0.38) 个。体长和肉刺总数的变异系数分别为0.33和0.31,体重的变异系数为1.04。体重的变异系数约为体长和肉刺总数变异系数的3倍,属于强度变异,体长和肉刺总数的变异系数大致相等,属于中度变异。由此可见,体长、体重和肉刺总数3个性状均具有很大的选择潜力。以家系为单因素对各经济性状的方差分析见表 3。从表 3可以看出,各相关性状在不同家系间差异极其显著(P < 0.01),说明这些性状具有较大的选择潜力。
9月龄刺参体长、体重和肉刺总数3个经济性状的方差分析结果见表 4。从表 4可以看出,对于9月龄大规格刺参苗种,其体长、体重和肉刺总数3个经济性状在雌性亲本间和雌内雄间的F检验均达到极显著水平(P < 0.01)。
根据公式(2)——公式(4),计算出9月龄雌性与配的雄性个体的有效平均后代数目K1、雄性个体的有效平均后代数目K2和雌性个体的有效平均后代数目K3。对于性状体长、体重而言,K1= K2=30,K3=112.70。对于性状肉刺总数而言:K1=48.85、K2=49.13、K3=183.93。根据方差分析结果,以各变异来源的均方与其期望均方相对应的建立方程,求解方差组分,分析结果见表 5。从表 5可以看出,9月龄刺参体长的雄性组分方差为0.52,雌性组分方差为0.53,雌雄组分方差大致相等;体重的雄性组分方差为4.50,雌性组分方差为1.21,雄性组分方差大于雌性组分方差;肉刺总数的雌性组分方差为17.63,雄性组分方差为13.22,雌性组分方差大于雄性组分方差。说明性状体长、体重在雌性亲本间个体变异较小,母性效应基本消失。
将各个表型变量原因方差组分依次代入公式(5)、公式(6)、公式(7),计算得到9月龄刺参体长、体重和肉刺总数3个经济性状的雌性组分、雌性内雄间组分及全同胞组分估计的狭义遗传力,根据公式(8)–公式(16) 计算的遗传力估计完成的显著性t检验的结果见表 6。从表 6可以看出,9月龄刺参体长雌性组分遗传力的估计值为0.87,雄性组分遗传力估计值为0.85,全同胞组分遗传力估计值为0.86;刺参体重雌性组分遗传力估计值为0.20,雄性组分遗传力估计值为0.73,全同胞组分遗传力估计值为0.46;肉刺总数雌性组分遗传力估计值为0.43,雄性组分遗传力估计值为0.32,全同胞组分遗传力估计值为0.37显示。t检验结果显示,9月龄刺参的体长和体重的全同胞组分遗传力达到了极显著水平(P < 0.01),而肉刺总数的全同胞组分的遗传力尚未达到显著水平(P > 0.05)。体长、肉刺总数2个性状的雌性组分遗传力大于雄内组分的遗传力,而体重的雌性组分遗传力要小于雄性组分的遗传力,这与方差组分分析结果一致。另外,由t值可以看出,性状体长、体重估计的遗传力比肉刺总数遗传力估计值要好,全同胞组分遗传力估计值比雄性组分遗传力估计值好,肉刺总数遗传力估计值均未达到显著水平。
个体育种值和群体遗传参数估计值的准确性是决定指导育种实践准确性的关键影响因素(王金玉等, 2004)。从统计学角度上分析,对遗传参数的估计本质是对方差组分的剖分与估计,其在遗传力、重复力和遗传相关3大群体遗传参数计算,预测误差、方差和遗传评定以及对遗传改良的预测中方差组分估计有重要意义(白俊艳等, 2006)。因此,提高方差组分估计的准确性是育种学家所追求的一项指标。水产动物多具有高繁殖性能的特性,因此,在进行遗传参数估计时多采用同胞分析进行。同胞分析所采用的方差组分估计方法,主要包括方差分析法、极大似然法(ML)和限制性极大似然法(REML)、最小范数二次无偏估计(MINQUE)和最小方差二次无偏估计法(MIVQUE)、贝叶斯法(Bayesian)、吉布斯抽样方法(宋传文等, 2013)。国内外学者利用不同方差组分估计方法对相同群体进行遗传参数评估表明,相应遗传评估方法各有特色(张胜利等, 1995;王勇强等, 1998; Duangjinda et al, 2001; Cantet et al, 2000),应根据所研究群体的家系背景、群体结构以及记录的完整性选取相应的方差组分估计方法。本研究按照不平衡巢式设计,Herdenson(1953) 所提出的不平衡数据方差组分估计方法仍有较大的使用价值,鉴于目前刺参遗传力方差组分估计方法报道较少,为了更方便的与前期刺参遗传力相关研究结果进行对比分析,本研究采用方差分析法进行刺参遗传力评估,后期将利用更精确的限制性极大似然法进行遗传力估计比较,为刺参遗传力计算提供更全面的参考数据。
针对不同的海水养殖经济物种,研究人员采用了不同的分析方法对遗传力进行评估。田永胜等(2015) 采用“加性–显性”线性模型、最小范氏无偏估计法对牙鲆(Paralichthys olivaceus)生长性状的边际平均值、狭义遗传力、广义遗传力、杂交随机效应等遗传参数进行了评估。王炳谦等(2013) 采用吉布斯抽样方法估计虹鳟(Oncorhynchus mykiss) IHN抗抗病力方差组分并计算IHNV抗病遗传力,并在此基础上进行了抗病家系研究。高保全等(2015) 采用REML方法对80和100日龄三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)生长性状遗传力进行了估计,结果显示,所测性状均属于中低度遗传力且适合家系选择育种。在刺参生长性状
遗传力方面,李云峰(2009) 利用MTDREML软件中的混合动物模型对耳状幼体阶段(授精后第5天)和稚参期(授精后第35天)刺参体长进行遗传力估计。栾生等(2006)和孟思远等(2010) 采用父系全同胞组内相关法分别对耳状幼体期刺参体长及稚参期(3–4月龄)4个生长性状遗传力进行了估计。刺参存在变态发育过程,在其浮游幼体期,变态过程较快且形态与成参完全不同,因此,在该阶段仅能进行体长性状的遗传力评估,无法获得体重、肉刺总数等相关经济性状的测定和分析;在刺参的稚参阶段,由于其肉刺总数等性状无法充分表征出来,该阶段的肉刺总数遗传力评估的精确性受到较大限制;随着刺参生长发育的进行,其体长、体重、肉刺总数等经济性状充分表征,测定的准确性和遗传力的准确性也随之提高,对选育实践的指导意义也大幅提升。因此,在对比前期研究基础之上,本研究采用巢式遗传设计构建了6个母系半同胞家系,23个全同胞家系,利用全同胞组内相关法对9月龄大规格苗种的遗传力进行了评估,为更全面的解析刺参不同发育时期的重要经济性状遗传力提供参考资料。
3.2 遗传力结果的分析目前,国内外对于遗传力有诸多研究报道。罗坤等(2015) 应用多性状动物模型对俄罗斯鲟(Acipenser gueldenstaedti)150日龄和410日龄的体长、体重遗传力进行了估计,分别为0.160、0.180和0.180、0.094。王正等(2015) 对三疣梭子蟹Ⅱ期幼蟹和80日龄幼蟹耐低盐性状进行了遗传力估计,发现耐低盐性状遗传力为低度遗传力,由此确定家系选育法更适合三疣梭子蟹耐低盐新品种的选育途径。贾永义等(2014) 利用半同胞组内相关分析法对日本沼虾(Macrobrachium nipponense)孵化后65 d和97 d体长、腹部长和体重3个性状的遗传力分析结果显示,日本沼虾适合利用家系选择和群体间杂交方法进行性状选择。杨创业等(2015) 估计了马氏珠母贝(Pinctada martensi)全同胞家系的壳长、壳宽、壳高的广义遗传力,结果显示,3个性状的广义遗传力均超过40%,属于中等遗传力。国外的研究报道对研究对象的遗传参数比较深入全面,García-Celdrán等(2015a、b、c)对金头鲷(Sparus aurata)的肉质性状、胴体性状及不同日龄生长性状和体型畸形率遗传参数做出了全面细致研究,为西班牙沿岸金头鲷良种选育提供了理论指导和参考。Caballero-Zamora等(2015) 估计了凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei) 130日龄体重的遗传力为(0.19±0.03);Hu等(2014) 估计了3个不同时间段大规格虹鳟鱼全长、体重的遗传力,其中,体重的遗传力估计范围为0.33– 0.98,全长的遗传力估计范围为0.05–0.51。由此可以看出,不同物种的体长和体重遗传力存在较大差别,且同一物种在不同的发育生长阶段各性状遗传力也存在很大差别。
目前,国内外关于刺参遗传力的研究报道较少,其中,栾生等(2006) 基于全同胞组内相关法估计了刺参耳状幼体初期和中期的遗传力,实验中估计的刺参耳状幼体初期和中期体长的狭义遗传力分别为0.74– 0.87和0.75–0.92,属于高遗传力范围。李云峰等(2009) 估计了刺参早期生长发育的遗传力,结果显示,耳状幼体阶段的体长遗传力为0.29,稚参阶段的体长遗传力为0.49,表明刺参的不同发育阶段体长的遗传力属于中度遗传力范围。孟思远(2010)等运用父系全同胞组内相关法估计了3月龄和4月龄仿刺参体长、体重、肉刺长度、肉刺总数的遗传力,结果显示,4个性状在不同发育阶段的遗传力属于中低度遗传力。为对比不同发育时期的遗传力,本研究对大规格苗种时期(9月龄)刺参的体长、体重、肉刺总数3个重要经济性状的遗传力进行评估,结果发现,刺参体长遗传力估计值与栾生等(2006) 得出的刺参耳状幼体初期0.74和中期0.75遗传力估计值接近,但要比孟思远等(2010)和李云峰等(2010) 所估计的刺参体长遗传力估计值要高。刺参体重遗传力估计值中,雌性组分半同胞遗传力估计值与孟思远等(2010) 所得出4月龄刺参体重遗传力估计值0.23接近,全同胞组分遗传力估计值要高于孟思远等(2010) 所得出3、4月龄刺参体重遗传力估计值(0.184和0.200)。综上所述,刺参幼参各阶段体长、体重的遗传力属于中高度遗传力,说明这2个生长性状均处于加性效应的控制下,其性状的表现型和基因型的相关程度较高,由表现型判断基因型及由上代判断下代的命中率较高,采用混合选择方式可获得较好的选育进展。9月龄刺参肉刺总数遗传力估计值t检验结果不显著,表明所得的估计值准确度欠佳,分析其原因可能是由于抽样误差太大,也可能由于刺参个体较小,肉刺总数统计时存在较大的主观性。
本研究所得出的遗传力数据补充和完善了刺参不同发育阶段的遗传力数据资料,为刺参遗传育种提供了重要参考和指导。鉴于刺参不同发育阶段其遗传力存在较大的差异,还需补充和深入研究刺参发育后期阶段和成参阶段相关经济性状的遗传参数。此外,针对肉刺总数遗传力的估计需要规范肉刺总数统计的手段和方法,为准确评估其遗传力奠定基础。
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