渔业科学进展  2017, Vol. 38 Issue (5): 41-49  DOI: 10.11758/yykxjz.20160503001
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引用本文 

李达, 刘长琳, 李昂, 杜腾飞, 柳淑芳, 庄志猛. 金乌贼(Sepia esculenta)早期发育阶段内壳形态学指标的主成分分析[J]. 渔业科学进展, 2017, 38(5): 41-49. DOI: 10.11758/yykxjz.20160503001.
LI Da, LIU Changlin, LI Ang, DU Tengfei, LIU Shufang, ZHUANG Zhimeng. Principal Component Analysis of the Morphometric Traits of the Cuttlebone of Sepia esculenta at Early Developmental Stages[J]. Progress in Fishery Sciences, 2017, 38(5): 41-49. DOI: 10.11758/yykxjz.20160503001.

基金项目

"十二五"农村领域国家科技计划课题(2012BAD18B03)、农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室开放课题(2014K01) 和基本科研业务费专项(20603022015009) 共同资助

作者简介

李达,E-mail: meiniandali@126.com

通讯作者

柳淑芳,研究员,E-mail: liusf@ysfri.ac.cn

文章历史

收稿日期:2016-05-03
收修改稿日期:2016-07-04
金乌贼(Sepia esculenta)早期发育阶段内壳形态学指标的主成分分析
李达1,2, 刘长琳2, 李昂2, 杜腾飞1,2, 柳淑芳2,3, 庄志猛2,4     
1. 上海海洋大学水产与生命学院 上海 201306;
2. 农业部海洋渔业可持续发展重点实验室 中国水产科学研究院 黄海水产研究所 青岛 266071;
3. 青岛海洋科学与技术国家实验室 海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室 青岛 266071;
4. 青岛海洋科学与技术国家实验室 海洋生物学与生物技术功能实验室 青岛 266071
摘要:为揭示金乌贼(Sepia esculenta)早期发育阶段内壳生长发育规律和形态学特征,本研究采集其红珠与黑珠期、心跳期、出膜期、初孵化幼体、5日龄、10日龄6个时期的金乌贼,分别测量其胴腹长(DML)、胴宽(MB)、体重(BW)、壳长(CL)、壳宽(CB),壳重(CW)、生长纹数(LN) 7项指标,进行内壳形态学的主成分分析。结果显示,红珠与黑珠期、出膜期和10日龄时期各生长指标间均呈显著性正相关,心跳期、初孵化幼体期和5日龄时期部分生长指标间相关性不显著。主成分分析显示,红珠与黑珠期、心跳期的第1主成分为质量因子(体重和壳重),出膜期、初孵化幼体、5日龄、10日龄等4个时期的第1主成分为长度因子(胴腹长和壳长),这表明金乌贼不同时期内壳形态学各性状的生长速率存在一定差异,出膜前(红珠与黑珠期和心跳期)质量因子的增长优于长度因子的增长,而出膜后(出膜期至10日龄时期)长度因子的增长优于质量因子的增长。
关键词金乌贼    生长性状    内壳    主成分分析    
Principal Component Analysis of the Morphometric Traits of the Cuttlebone of Sepia esculenta at Early Developmental Stages
LI Da1,2, LIU Changlin2, LI Ang2, DU Tengfei1,2, LIU Shufang2,3, ZHUANG Zhimeng2,4     
1. College of Fisheries and Life Science, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306;
2. Key Laboratory of Sustainable Development of Marine Fisheries, Ministry of Agriculture, Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Qingdao 266071;
3. Laboratory for Marine Fisheries Science and Food Production Processes, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao 266071;
4. Laboratory for Marine Biology and Biotechnology, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao 266071
Corresponding author: LIU Shufang, E-mail: liusf@ysfri.ac.cn
Fund: This work was supported by the National Scientific and Technological Projects in Rural Areas in 12th Five-Year (2012BAD18B03), Key Laboratory of Exploitation and Utilization of Ocean Resources in the East China Sea, MOA (2014K01) and Central Public-Interest Scientific Institution Basal Research Fund (20603022015009)
Abstract: To characterize the traits of the cuttlebone of Sepia esculenta at the early developmental stages, we collected data at different stages including the red-bead and black-bead stage, the heart-beating stage, the hatching stage, the newly-hatched larvae stage, the 5-day-old stage and the 10-day-old stage. The principal component analysis was performed to evaluate seven growth traits including the dorsal mantle length, the mantle breadth, the body weight, the cuttlebone length, the cuttlebone breadth, the cuttlebone weight and the lamella number. The results showed that there were significant correlations between any two traits at the red-bead and black-bead stage, the hatching stage and the 10-day-old stage. However, some traits showed no correlation at the heart-beating stage, the newly-hatched larvae stage and the 5-day-old stage. The first principal component was the weight factor at the first two stages, and it became the length factor at other four stages. The second principal component was the length factor and width factor. The third principal component was mostly the width factor. At only two stages there was the fourth principal component that was the lamella factor and the width factor. The growth rate of these traits varied at different stages. From the red-bead and black-bead stage to the heart-beating stage, the morphometric traits outgrew the body weight, and this pattern was reversed from the hatching stage to the 10-day-old stage.
Key words: Sepia esculenta    Growth traits    Cuttlebone    Principal component analysis    

金乌贼(Sepia esculenta)属于头足纲(Cephalopoda)、乌贼目(Sepioidea)、乌贼科(Sepiidea)(陈新军等, 2009),广泛分布于中国沿海、日本列岛以及菲律宾群岛海域(董正之, 1991)。金乌贼具有生命周期短、生长速度快、营养价值高等特点,为我国北方沿海经济价值较大的头足类,曾是我国重要的海洋渔业捕捞对象之一(董正之, 1991)。但自20世纪80年代以来,由于过度捕捞和海洋环境的破坏等多种原因,其资源量明显衰退,产量急剧下降,目前,金乌贼在许多海域已经绝迹(郝振林等, 2007; 唐启升等, 1990)。因此,进一步探索金乌贼生物学特征,对更好地保护金乌贼野生资源和提高增养殖效果尤为重要。金乌贼的内壳又称海螵蛸,既是身体唯一的支撑结构,也是乌贼垂直运动时所依赖的浮力结构(Bandel et al, 1979)。海螵蛸因其具有较高的药用价值,得到了广泛研究,但报道多集中于药学方面(刘永刚等, 2005; 张健英等, 1993; 赵中杰等, 1990),而头足类内壳发生和生长发育过程及其机理探讨方面的研究几乎空白。

为了更好地了解海螵蛸的形态与功能,推测海螵蛸的形成过程以及形成机理,本研究以早期不同发育阶段的金乌贼为研究对象,采集相关生长性状指标数据,并采用主成分分析法,以揭示金乌贼早期发育阶段内壳生长发育规律和形态学特征,为金乌贼幼苗的选育及养殖提供参考依据。

1 材料与方法 1.1 实验材料

将受精卵在面积为25 m2、池深为1 m的培育池中孵化。池中均匀设置12个气石,保证孵化过程中进行不间断地微量充气,使水中溶氧量≥6 mg/L。光照维持在400–600 lx。孵化用经过二级砂滤的自然海水,培育水温为20–25℃,盐度为29–30,pH 7.8–8.0,并定期更换海水。出膜后幼体的培育条件与孵化条件相同。每天09:00和18:00投饵2次,投喂的饵料和金乌贼幼体的数量比例为20:1–30:1。0–5日龄幼体投喂卤虫无节幼体和活体糠虾,5–10日龄投喂活体糠虾。实验期间,从培育池中分6个时期随机取样,分别获得样品红珠与黑珠期30尾、心跳期29尾、出膜期30尾、初孵化幼体26尾、5日龄30尾、10日龄30尾,共175尾。

1.2 生物学指标测定

用游标卡尺测定金乌贼的胴腹长(DML)、胴宽(MB)后,用精密电子天平(Sartorius)测定体重(BW),将其解剖,取出内壳,测定骨板壳长(CL)、壳宽(CB),在解剖镜下测定生长纹数(LN),最后称其壳重(CW) (表 1图 1)。

图 1 金乌贼壳测量参数 Figure 1 Scheme of morphometric measurements of the cuttlebone
表 1 金乌贼早期发育阶段部分测量参数 Table 1 Morphometric measurements of S. esculenta at the early developmental stages
1.3 数据处理及分析方法 1.3.1 统计软件

用SPSS 19.0、Sigma plot 12.5、Excel等软件进行数据处理。

1.3.2 分析方法

由于原始数据单位度量不同,不能在同一水平上进行比较,因此,在分析之前,通常需要通过z-score(标准差)标准化处理数据来消除量纲和数量级的影响。标准化函数为:

$ {x^*} = (x - \mu)/\sigma $

式中,x*为标准化后的数据,x为原始数据,μ为样本数据的均值,σ为样本数据的标准差。

标准化后共得到6组标准化指标,用SPSS 19.0对标准化指标进行主成分分析,具体操作步骤和所得结果的分析方法参照王国梁等(2005)。为了有效保留原始数据所含的信息量,提取主成分时,通常使累计贡献率大于85%,这样保证结果基本涵盖金乌贼早期发育阶段原始形态生长性状的全部遗传信息。

2 结果 2.1 金乌贼早期各生长性状的测量结果

本研究共测量金乌贼早期发育阶段红珠与黑珠期、心跳期、出膜期、初孵化幼体、5日龄、10日龄等6个时期的壳长(CL)、壳宽(CB)、壳重(CW)、生长纹数(LN)、胴腹长(DML)、胴宽(MB)、体重(BW)等7个生长性状的数据,详见表 2。从表 2可以看出,红珠与黑珠期、心跳期、出膜期、初孵化幼体期各性状的变化范围较大,5日龄期、10日龄期的变化范围较小。在本培育条件下,从红珠与黑珠期到初孵化幼体耗时16 d,据此可以推断,出膜前的1个生长纹形成需要2.43 d,而出膜后的生长纹数日增长为4.95 d,生长纹数的增长速率呈现先快后慢的特点。

表 2 表 2金乌贼早期发育阶段各生物学性状的描述性统计 Table 2 Descriptive statistics of biological traits of S. esculenta at early developmental stages
2.2 金乌贼内壳不同生长时期各生长性状间的相关性

根据所测形态特征数据,利用相关系数法获得的相关系数矩阵如表 3。从表 3可以看出,红珠与黑珠期、出膜期和10日龄期各生物性状间均呈极显著性正相关(P < 0.01);心跳期,除胴腹长与部分性状、胴宽与壳重间相关性不显著(P > 0.05) 外,其他性状间呈显著性正相关(P < 0.05);初孵化幼体期,除胴宽与部分性状相关性不显著外(P > 0.05),其他性状间呈极显著性正相关(P < 0.01);5日龄时期,除胴腹长与部分性状、胴宽与部分性状间相关性不显著(P > 0.05) 外,其他性状间呈显著性正相关(P < 0.05)

表 3 金乌贼早期发育阶段不同时期内壳与各生长性状的相关系数 Table 3 The phenotype correlation coefficient among the traits of S. esculenta at early different developmental stages
2.3 金乌贼内壳生长性状的主成分分析

本研究在金乌贼早期发育阶段的6个时期选取的主成分特征值及贡献率见表 4,成分矩阵见表 5。初孵化幼体期和5日龄时期分别提取4个主成分,其他时期提取3个主成分,6个时期入选的主成分略有差别。

表 4 金乌贼早期发育阶段不同时期生长性状的特征值和累计贡献率 Table 4 Eigenvector and cumulative contribution rate of S. esculenta at early different developmental stages
表 5 金乌贼早期发育阶段不同时期入选成分的特征向量 Table 5 Principal eigenvector of S. esculenta at early different developmental stages

红珠与黑珠期第1主成分贡献率为71.489%,贡献率较大的为体重、壳长和壳重特征向量,且体重与壳长、壳重间呈显著正相关,可将其称为质量因子;第2主成分的贡献率为9.547%,贡献率较大的为胴宽和壳宽特征向量,可以称为宽度因子,其中,壳宽特征向量为负值,说明这段时期胴宽越宽,则壳宽越窄;第3主成分的贡献率为7.946%,贡献率较大的为生长纹数生长向量,可以称为层数因子,且其特征值为负,说明此时期金乌贼幼体增长速度越快,骨板形成速度越慢。前3个主成分的累计贡献率为88.983%。

心跳期,第1主成分的贡献率为58.886%,贡献较大的为胴宽、体重、壳长、壳宽和生长纹数5个特征向量,可以称之为质量–层数因子,其中,生长纹数特征向量最大,说明这个时期金乌贼幼体内壳骨板快速形成,伴随着骨板的形成,壳长和壳宽也开始快速增长;第2主成分的贡献率为15.159%,贡献率较大的为胴腹长特征向量(长度因子);第3主成分的贡献率为12.183%,贡献率较大的为胴宽特征向量(宽度因子),且其特征值为负,这个时期胴宽的增长速度缓慢。前3个主成分的累计贡献率为86.228%。

出膜期,第1主成分的贡献率为71.879%,贡献率较大的为胴宽、壳长、壳宽和生长纹数,可以称之为长度因子,与心跳期相比,第1主成分仍有壳长、壳宽和生长纹数,但其特征值所占比重已有所下降,说明出膜期内壳形成速度较心跳期有所减慢;第2主成分的贡献率为9.361%,贡献率较大的为胴腹长和体重特征向量,可以称之为长度因子,这个时期胴腹长仍在缓慢增长,而体重也在缓慢增长,但增长速度较心跳期有所下降;第3主成分的贡献率为5.889%,贡献率较大为壳重特征向量,可以称之为质量因子。前3个主成分的累计贡献率为87.129%。

初孵化幼体期,第1主成分的贡献率为61.927%,贡献率较大的为体重、壳长特征向量,可以称之为长度因子,孵化后的金乌贼幼体的胴腹长和壳长都快速增长,而且伴随着胴腹长和壳长的快速增长,体重和壳重也快速增长;第2主成分的贡献率为13.390%,贡献率较大的为胴宽和壳重特征向量,可以称之为宽度因子,说明这个时期胴宽仍处于明显的增长趋势;第3主成分的贡献率为8.988%,贡献率较大的为胴腹长和壳宽特征向量,可以称之为宽度因子,这个时期壳宽还在增长,但增长速度减慢;第4主成分的贡献率为5.830%,贡献率较大的为生长纹数特征向量,可以称之为层数因子。前4个主成分的累计贡献率为90.145%。

5日龄时期,第1主成分的贡献率为53.716%,贡献率较大的为体重、壳长和壳宽特征向量,可以称之为长度因子,这个时期体重和壳长仍然快速增长;第2主成分的贡献率为14.026%,贡献率较大的为胴腹长特征向量,可以称之为长度因子,这个时期胴腹长仍处于明显的增长趋势,但较初孵化幼体时期已有所减慢;第3主成分的贡献率为11.465%,贡献率较大的为胴宽和纹数特征向量,可以称之为宽度因子,其中,胴宽特征向量值为负,而生长纹数特征向量为正,说明生长纹数越大,胴宽越小;第4主成分的贡献率为8.932%,贡献率较大的为壳宽和壳重特征向量,可以称之为宽度因子。前4个主成分的累计贡献率为88.140%。

10日龄时期,第1主成分的贡献率为69.668%,贡献率较大的为胴腹长和壳长特征向量,可以称之为长度因子,其中,体重和胴宽的特征值也较大,说明随着胴腹长和胴宽的增长,体重也快速增长;第2主成分的贡献率为10.638%,贡献率较大的为纹数特征向量,可以称之为层数因子;第3主成分的贡献率为7.506%,贡献率较大的为胴宽、壳宽和壳重特征向量,可以称之为宽度因子,其中,胴宽的特征值为负,而壳宽的特征值为正,说明胴宽越大的金乌贼幼体,其个体壳宽越小。前3个主成分的累计贡献率为87.811%。

3 讨论

人工养殖是补充金乌贼资源的有效方法,但金乌贼幼体生长生物学知识的缺乏使得目前人工培育幼体的成活率较低,而研究金乌贼内壳的形态学发育对提高幼体成活率具有重要参考价值。本研究发现,在金乌贼发育早期的6个不同时期,内壳形态学各性状的生长速率存在一定差异,出膜前(红珠与黑珠期和心跳期)质量因子的增长优于长度因子的增长,而出膜后(出膜期至10日龄时期)长度因子的增长优于质量因子的增长,但其中代表内壳发育的壳长都是最重要的参数。对于其他指标,本研究采用了主成分分析法,该方法是将原来众多具有一定相关性的指标,重新组合成一组新的互相无关的综合指标来代替原来指标的一种多元分析方法(余锦华等, 2005)。它可以反映多个实测指标的主要信息,在进行分析与评价指标变量时,能够切断相关的干扰,找出主导因素,从而做出更为准确的估计与评价(蔺宏凯等, 2010)。目前,在水产动物中,主成分分析法主要用于研究群体系统分类(刘晓慧等, 2015; 孙诗萌等, 2015; 郑汉丰等, 2005),而对头足类生长性状的主成分分析鲜见报道,国内仅见凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei) (何铜等, 2009)、三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus) (王燕飞等, 2014)、翘嘴鲌(Siniperca chuatsi) (窦亚琪等, 2014)、高体革鯻(Scortum barcoo) (于飞等, 2009)等的相关研究。本研究是首次尝试用主成分分析法分析金乌贼的内壳形态学特征。

按照主成分分析中关于累计贡献率和特征向量的生物学含义,累计贡献率为各复合性状相对于所有复合性状对于遗传方差的贡献的百分率;特征向量表示对复合性状贡献的大小,其绝对值反映了各性状对该主成分作用的大小和性质(耿社民等, 1997)。体尺性状与体重性状均属于数量性状,是环境和遗传因素共同作用的结果,是动物遗传选育重要的表型性状与体型外貌的量化指标(蔺宏凯等, 2010)。本研究由不同时期生长性状的相关分析可知,红珠与黑珠期、出膜期和10日龄期各生物性状间均呈显著性正相关,心跳期、初孵化幼体期和5日龄时期部分性状间相关性不显著。相关分析虽然可以了解各生长阶段不同性状参数的相互关系,但无法消除性状间彼此相关而造成的信息重叠,为此,进行主成分分析,将复杂的数据综合成几个简单的综合性状(侯建君等, 2006)。本研究不同时期主成分分析结果见表 6,从表 6可以看出,金乌贼早期发育阶段不同时期主成分有所不同,同一主成分在不同时期所占的比重也不同。第1主成分在前2个时期为质量因子,后4个时期为长度因子;第2主成分主要为长度因子和宽度因子;第3主成分大部分为宽度因子;第4主成分只有2个时期存在,分别为层数因子和宽度因子。同时主成分分析结果表明,大部分时期只要抓住前3个主成分,就能抓住7个生长指标85%以上的信息,红珠与黑珠期和心跳期质量的增长优于形态特征的增长,而从出膜期至10日龄时期形态特征的增长优于质量的增长。分析原因可能是,幼体出膜后为了躲避天敌和主动摄食,将能量主要用于运动器官和摄食器官的形成,这种现象被称为异速生长,并且在其他物种中已经得到证实(单秀娟等, 2009; 马境等, 2007)。在所有时期中,第1主成分所占的贡献率均在总的贡献率的50%以上,说明它是金乌贼早期个体形态性状变异的主要来源,由于生物体各性状间存在遗传相关,一个性状的改变会导致另一个性状的选择反应,因此,在选育工作中可根据第1主成分为主进行选择,也就是在出膜前(红珠与黑珠期、心跳期)以体重为重要的形态性状选择指标,出膜后(出膜期、初孵化幼体期、5日龄期和10日龄期)则以内壳壳长和胴腹长为重要的选择指标,依此可提高金乌贼的选育效率。

表 6 金乌贼早期发育阶段不同时期的主成分 Table 6 Principal components of traits of S. esculenta at early different developmental stages
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