Worm Sipunculus nudus
热休克蛋白热休克蛋白(Heat shock proteins, Hsps)是目前研究最为广泛的应激蛋白之一,可在各种环境胁迫下诱导大量表达;在正常环境条件下,细胞内也存在丰富的Hsps;根据分子量大小,Hsps可以分为Hsp110s、Hsp90s、Hsp70s、Hsp60s和小分子量Hsps等多个家族(Lindquist et al, 1988)。其中,Hsp90是一类进化上高度保守的重要细胞内伴侣蛋白,在正常情况约占细胞溶质蛋白总量的1%~2%(Lai et al, 1984),具有辅助蛋白质正确折叠、胞内物质运输、细胞增殖调控等重要功能(McClellan et al, 2007)。此外,Hsp90在配子发生中也具有重要功能。例如,非洲爪蟾(Xenopus laevis)卵母细胞的Hsp90可通过磷酸化稳定c-Mos蛋白,并依赖丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-activated protein kinase, MAPK)途径影响成熟促进因子(Maturation-promoting Factor, MPF)的合成(朱建安, 2007)。在刀额新对虾(Metapenaeus ensis)卵母细胞中,Hsp90与雌激素受体(Estrogen receptor, ER)共同作用,激活或增强卵黄蛋白原(Vitellogenin, Vg)等靶基因的转录(Wu et al, 2008)。
光裸星虫(Sipunculus nudus)又名裸体方格星虫,俗称沙虫,主要栖息于暖水性海滨潮间带,在我国华南沿海资源量较为丰富(李凤鲁等, 1990; Li et al, 2017),其味道鲜美,含有大量谷氨酸、天冬氨酸等呈味氨基酸,具有很高的市场价值(罗少杰等, 2016)。近年来,光裸星虫逐渐成为广东湛江、广西北海等北部湾沿岸地区养殖新热点,但苗种短缺制约了产业发展。目前,关于光裸星虫繁殖生物学研究主要在形态学方面,尚未开展分子机制研究。如,王庆恒等(2017)报道了光裸星虫卵子发生的超微结构,建立了卵母细胞粒径、超微结构和发育阶段的对应关系;张家炜等(2018a)观察了光裸星虫胚胎和幼体发育的超微结构。光裸星虫体腔液中有大量生殖细胞游离发育,但直接解剖获取的卵母细胞不具备受精能力。解析卵母细胞成熟机制,有助于建立卵母细胞体外促熟技术,从而提高光裸星虫苗种产量,促进产业发展。作者所在课题组已构建了不同发育阶段卵子的转录组文库,分析表明,Hsp90在卵母细胞中表达量较高,可能在卵母细胞发育过程中起着重要作用(未发表)。
本研究通过RACE技术获得SnHsp90的cDNA全长,并对其序列结构、不同组织及不同卵子发育时期的表达模式进行分析,以探究SnHsp90在光裸星虫卵母细胞发育中的作用,为认识光裸星虫卵母细胞发育的分子机制积累基础资料。
1 材料与方法 1.1 实验材料实验所用光裸星虫于2018年6月采集自广东省湛江市草潭镇潮间带,取钻沙有力、体壁无伤的雌性虫体用于实验,体重为(12.92±1.68) g。
灭菌海水清洗虫体表面砂砾后,用2 ml注射器抽取少量体腔液,镜检分辨雌雄。取30尾雌虫,每尾抽取2 ml体腔液,分别置于5 ml离心管中冰浴静置5 min,卵母细胞沉降到管底,上层悬浮液中则含有各类血细胞、卵原细胞等。弃悬浮液,在沉淀中加入RNA Later吹打混匀,冰浴静置5 min,弃上清液,再次加入RNA Later吹打混匀。将获得的卵母细胞悬浮液全部置于50 ml烧杯中混合,逐次使用100、150和300目的细胞筛进行分级分离,结合王庆恒等(2017)工作,获得的各级卵母细胞的直径及发育时期分别为:Egg1 (< 48 μm,卵黄形成初期)、Egg2 (48~108 μm,卵黄旺盛合成前期)、Egg3 (108~150 μm,卵黄旺盛合成后期)和Egg4 (> 150 μm,成熟期)(图 1)。
解剖雌虫,如果肾管充盈,即用过滤海水清洗肾管表面,将肾管游离端轻轻放入2 ml离心管中,用解剖针刺破肾管收集卵母细胞,加入RNA Later吹打混匀。本研究共获得30尾雌虫肾管中的卵母细胞,混合后作为样品Egg5 (肾管发育时期)。另取30尾雌虫,阴干刺激后放入过滤海水中促使排卵,用100目筛绢网捞取水体中的外排卵母细胞,加入RNA Later吹打混匀作为样品Egg6 (外排卵母细胞)。
解剖取9尾雌虫取体壁(M)、肠道(I)、收吻肌(Rm)、肾管(Ne)组织以及体腔液细胞(Co),液氮速冻,并转移至–80℃冰箱保存,用于RNA提取。
1.2 SnHsp90基因全长cDNA克隆总RNA提取及第一链cDNA合成参照赖卓欣等(2019)的方法进行。根据本课题组前期光裸星虫转录组数据中Hsp90的部分序列,利用Primer premier 6.0软件设计引物(表 1)。
采用巢式PCR扩增SnHsp90 3´UTR和5´UTR,PCR产物利用1%琼脂糖电泳检测,产物与载体pMD18-T连接,连接产物转化至DH5α感受态细胞,并在固体氨苄选择培养基上培养12 h。挑取阳性单克隆菌落进行PCR检测,合格后送至生工生物工程(上海)股份有限公司测序。
1.3 SnHsp90序列分析利用DNAman 8对测序结果进行拼接,获得SnHsp90全长。采用ORF Finder (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder)预测SnHsp90的开放阅读框(Open Reading Frame, ORF)以及蛋白质氨基酸序列。利用ProtParam(https://web.expasy.org/protparam/)进行理化性质及二级结构预测。ProtComp 9.0(http://linux1.softberry.com/berry.phtml?topic=protcompan&group=programs&subgroup=proloc)进行蛋白亚细胞定位。NCBI Blast在线分析工具(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)进行序列同源性、一致性性分析。Phyer2 (http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/~phyre2/html/page.cgi?id=index)预测蛋白三级结构。smart进行保守结构域预测(http://smart.embl-heidelberg.de/)。MEME (http://meme-suite.org/index.html)进行motif挖掘。使用Mega X构建生物系统进化树。
1.4 SnHsp90差异表达分析分别以TBP(张家炜等, 2018b)和60s-L7(筛选过程未发表)基因作为内参基因,检测SnHsp90在成体不同组织及在不同发育时期卵母细胞的表达水平。反应体系:上下游引物各0.4 μl,SYBR® Select Master Mix 5 μl,cDNA模板0.4 μl,灭菌水3.8 μl。反应条件:95℃预变性2 min,95℃变性15 s,60℃退火延伸1 min,共40个循环。采用2–ΔΔCt法计算SnHsp90的相对表达量。通过IBM SPSS Statistics 22进行显著性分析(置信水平取95%)。
2 结果与分析 2.1 SnHsp90基因克隆及氨基酸序列本研究利用RACE技术克隆获得光裸星虫SnHsp90基因cDNA序列,全长3110 bp,其中,5′ UTR为72 bp;3′ UTR为582 bp,开放式阅读框(ORF)长度为2456 bp,编码818个氨基酸。SnHsp90同时具有B型Hsp90(Hsp90B)的3个特征序列(FLREL、IGQFGVGFYS、LPLNVSRE)以及保守模块“GxxGxG” (图 2)。
利用ProtParam预测得到SnHsp90的理论分子量为93.839 kDa,等电点为4.75,负电荷残基178个,正电荷残基114个。结果显示,其脂溶指数(Aliphatic index)为77.98,总平均亲水性(Grand average of hydropathy, GRAVY)为–0.752,属于亲水性蛋白。使用SOPMA软件对SnHsp90二级结构进行预测,发现螺旋、转角和延伸链分别占整体的55.87%、4.28%和12.59%。细胞亚定位预测结果显示,SnHsp90定位于内质网上。结构域分析显示,不同物种的Hsp90都含有信号肽、组氨酸激酶结构域(HATPase-c Domain)和热休克蛋白结构域(Hsp90 Domain)(图 3),可见Hsp90蛋白在结构域上具有高度保守性。
对来源于鸭嘴海豆芽(Lingula anatine, XP_ 023932276.1)、小头虫(Capitella teleta, ELU00023.1)、福寿螺(Pomacea canaliculated, XP_025107756.1)、太平洋牡蛎(Crassostrea gigas, BAF63637.1)、水蛭(Helobdella robusta, XP_009019107.1)、猫头鹰帽贝(Lottia gigantean, XP_009065664.1)、虾夷扇贝(Mizuhopecten yessoensis, OWF41993.1)、白氏文昌鱼(Branchiostoma belcheri, XP_019627224.1)、棘冠海星(Acanthaster planci, XP_022100344.1)、斑马拟丽鱼(Maylandia zebra, XP_004567801.1)、尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus, XP_003443932.1)、杂色鳉(Cyprinodon variegatus, XP_015232211.1)、隆头蛛(Stegodyphus mimosarum, KFM57735.1)、银大马哈鱼(Oncorhynchus kisutch, XP_020311813.1)、大弹涂鱼(Boleophthalmus pectinirostris, XP_020790709.1)的Hsp90蛋白与光裸星虫Hsp90序列进行motif分析,结果表明,各物种Hsp90蛋白序列保守性较高(图 4)。其中,光裸星虫Hsp90与鸭嘴海豆芽的相似性最高,为77.72%;与大弹涂鱼的相似性最低,为69.18%。对不同物种的Hsp90蛋白序列进行Motif分析,发现这些物种均具有Motif (1~10),且相对位置一致,进一步表明Hsp90蛋白在序列上的保守性。
对来自小头虫、鸭嘴海豆芽、水蛭的Hsp90和SnHsp90进行三级结构预测,结果发现,光裸星虫与鸭嘴海豆芽、小头虫、水蛭Hsp90在三级结果上相似性很高(图 5),说明Hsp90蛋白的三级结构非常保守。
利用最大似然法(Maximum likelihood),选择光裸星虫、太平洋牡蛎、福寿螺、猫头鹰帽贝、虾夷扇贝、鸭嘴海豆芽、小头虫、水蛭、白氏文昌鱼、杂色鳉、尼罗罗非鱼、斑马拟丽鱼、大弹涂鱼以及银大马哈鱼的Hsp90蛋白序列构建系统进化发育树。结果显示,Hsp90系统发育树可分为无脊椎动物和脊椎动物两大支,在无脊椎动物中,光裸星虫Hsp90与水蛭、小头虫等环节动物聚为一支,再与鸭嘴海豆芽、太平洋牡蛎、虾夷扇贝等软体动物聚为一支(图 6)。系统发育树聚类结果与传统分类学结果一致。
利用qRT-PCR对SnHsp90进行不同组织的表达模式分析,结果显示,SnHsp90在光裸星虫的各个组织中均有表达,且收吻肌中表达量最高,差异显著(P < 0.05) (图 7)。
如图 8所示,SnHsp90在不同发育时期卵母细胞中均有表达。其中,在Egg6的表达量显著高于其他时期(P < 0.05),Egg2表达量显著高于Egg1和Egg3~5 (P < 0.05)。
生殖细胞发生是水产动物繁殖生物学研究的重要内容。近年来,通过构建不同发育时期性腺的转录组文库,已发掘了大量与水产动物繁殖相关的关键基因。例如,袁静(2013)比较分析了5~180日龄尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)性腺转录组,发现雌雄性腺特异表达的基因分别为69个和259个。林睿涓(2017)利用七彩神仙鱼(Symphysodon haraldi)性腺转录组文库,筛选出12个与性别决定、性腺发育和性激素调控相关的重要功能基因。本课题组前期构建了光裸星虫卵母细胞的转录组文库,分析发现Hsp90在各时期卵母细胞均具有较高的表达水平(未发表),暗示着其在卵母细胞或胚胎发育中承担着重要作用。本研究通过分析SnHsp90的序列特征及表达模式,探索其在卵母细胞发育中可能具有的功能。
Hsp90家族可分为Hsp90A、Hsp90B、TNF受体相关因子(TNF receptor associated factors, TRAP)、Hsp90C、高温蛋白G (High-temperature protein G, HTPG) 5个亚家族,其中,Hsp90B定位于真核生物内质网中,含有信号肽结构,序列上同时存在“FLREL”、“IGQFGVGFYS”及“LPLNVSRE” 3个标签序列(Chen et al, 2006)。本研究利用RACE方法克隆获得SnHsp90 cDNA全长序列,显示SnHsp90具有信号肽结构,且存在Hsp90B亚家族的上述3个特征序列标签,可见本研究克隆所得的SnHsp90属于Hsp90B亚家族。一般来说,Hsp90B亚家族的C末端具有内质网定位序列“KDEL”。然而,有研究指出,该序列在Hsp90B中并不保守,其K位点和D位点会发生一定的变化(Gupta, 1995; Chen et al, 2006)。这与本研究发现的SnHsp90氨基酸序列C末端序列为“HTEL”的结果一致。
对软体动物、棘皮动物、脊椎动物等16个物种进行motif搜索,发现不同物种间搜索出来的motif类型、数目以及排列顺序上均一致;光裸星虫、鸭嘴海豆芽、小头虫和水蛭同源Hsp90在三维结构上高度相似。以上结果均说明了Hsp90在二级和三级序列上均具有较高的保守性。
Hsp90B也称为葡萄糖调节的蛋白(Glucose regulated protein 94 kDa, Grp94) (Gupta, 1995; Chen et al, 2006),作为分子伴侣时,有助于蛋白质的正确折叠以及防止错误折叠蛋白的积累(Young et al, 2001; Mamipour et al, 2017; Krüger et al, 2019);参与免疫球蛋白、Toll样受体(Toll-like receptors, TLRs)和某些整联蛋白(Integrin)的折叠、组装和转运等过程(Melnick et al, 1992; Yang et al, 2007)。本研究中,SnHsp90在收吻肌、体壁、肠等组织中均有表达,提示该基因广泛参与了各组织的生理活动。在收吻肌的参与下,光裸星虫的吻可快速伸缩进行摄食和钻穴。在频繁的强力伸缩过程中,收吻肌的细胞可能发生损伤,SnHsp90在收吻肌中的表达量显著高于其他组织,推测与细胞的损伤修复有关。
卵母细胞发育过程中,核糖体、内质网、高尔基体等细胞器大量增殖,积累大量酶、蛋白质、mRNA等物质。本研究显示,SnHsp90在光裸星虫各时期卵母细胞中均有较高表达,有利于快速合成蛋白的正确折叠,与卵母细胞旺盛的转录和翻译活动相一致。有研究显示,Hsp90可与Greatwall激酶结合,影响生殖细胞的细胞周期进程(Yamamoto et al, 2014)。在刀额新对虾中,Hsp90与雌激素受体结合,介导雌激素信号转导过程,开启靶基因如卵黄蛋白原的转录(Wu et al, 2008)。光裸星虫卵母细胞Egg2处于卵黄旺盛合成前期,卵黄快速积累(王庆恒等, 2017),本研究显示,光裸星虫SnHsp90在该时期显著高表达(P < 0.05),暗示SnHsp90的表达可能与卵黄合成之间存在相关性,与刀额新对虾的研究结果相似。
Hsp90在水生生物应激和抗逆过程中具有重要作用。例如,Hsp90B在莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)耐盐群体的细胞中表达上调,可能在盐度耐受方面起作用(Sithtisarn et al, 2017);三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)具有2个Hsp90基因,对胁迫条件可产生不同的响应,例如,热处理导致Hsp90-1的表达量显著上调,而Hsp90-2则显著下调(Zhang et al, 2009);氨氮胁迫下,中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)鳃、肝胰腺、肌肉和血细胞的Hsp90表达量均在短时间内明显上调,有利于防止分子氨对组织细胞的损伤(王芸等, 2013)。本研究中,Egg6是经肾管排放到水体中的卵母细胞,需要应对体内外渗透压、pH、离子浓度等环境因子的重大改变,SnHsp90在Egg6时期表达量最高,暗示SnHsp90的高表达可能与卵母细胞应对环境变化密切相关。
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