TY - JOUR ID - 10.11758/yykxjz.20150617002 TI - 中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis) coat-ε基因全长cDNA克隆及组织分布 AU - 王修芳 AU - 刘庆慧 AU - 吴 垠 AU - 黄 倢 VL - 37 IS - 4 PB - 中国水产科学研究院黄海水产研究所 SP - 147 EP - 152 PY - JF - 渔业科学进展 JA - UR - http://journal.yykxjz.cn/yykxjz/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=20150617002&flag=1 KW - 中国明对虾;coat-ε;基因克隆;组织分布 KW - Fenneropenaeus chinensis; Coat-ε; Gene clone; Tissue distribution AB - coat-ε基因表达的蛋白是组成COPⅠ的coatomer复合体的一个亚基,为获得中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis) coat-ε基因全长序列,采用cDNA末端快速扩增(Rapid amplification of cDNA end, RACE)技术,扩增出coat-ε基因的3¢端和5¢端,测序结果经DNAMAN比对拼接得出coat-ε基因全长,基因全长1402 bp,5¢非编码区(UTR) 84 bp,3¢非编码区(UTR) 310 bp,开放阅读框1008 bp,预测编码335个氨基酸,其中,第230–300的氨基酸属于TPR超家族,SignalP 3.0 Server预测氨基酸序列没有信号肽,TMHMM Server v. 2.0分析此氨基酸不存在跨膜结构,PSORTⅡ Prediction预测该蛋白位于线粒体、细胞质、内质网中,属胞内蛋白。系统进化树显示,中国明对虾的coat-ε基因与节肢动物门的动物亲缘关系相近。采用实时荧光定量方法分析该基因在鳃、上皮、胃、肌肉、肝胰腺等不同组织中的相对表达,结果显示,coat-ε在肌肉中的相对转录表达量最高,在鳃和附肢的表达次之。本研究获得的中国明对虾coat-ε全长序列,可为该基因功能研究提供基础。 ER -