文章摘要
环境DNA在水体中存留时间的检测研究
Study on the Detection of Environmental DNA in Water
投稿时间:2018-09-06  修订日期:2018-12-05
DOI:
中文关键词: 环境DNA  存留时间  中国对虾  
英文关键词: environmental DNA  retention time  Fenneropenaeus chinensis
基金项目:
作者单位E-mail
李 苗 农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室 山东省渔业资源与生态环境重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛
上海海洋大学海洋科学学院 上海 
limiao0417@126.com 
单秀娟 农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室 山东省渔业资源与生态环境重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 266071青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室 青岛 266071 shanxj@ysfri.ac.cn 
王伟继 青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室 青岛
农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室 山东省渔业资源与生态环境重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 
 
丁小松 农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室 山东省渔业资源与生态环境重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛
上海海洋大学海洋科学学院 上海 
 
戴芳群 青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室 青岛
农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室 山东省渔业资源与生态环境重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 
 
吕 丁 农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室 山东省渔业资源与生态环境重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 266071  
吴欢欢 农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室 山东省渔业资源与生态环境重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 266071  
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中文摘要:
      精确地掌握物种的分布与种群动态是保护生物学的基础。然而,对于某些具有特殊生活史的物种以及群体数量非常少的种群而言,物种分布检测极其困难。DNA条形码技术与环境DNA(environmental DNA, eDNA)的结合使以上困难得以解决。鉴于eDNA易降解以及在环境中含量低的特性,探究其在环境中持续存留时间对于后续进行准确地定性与定量分析至关重要。本研究以中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)为研究对象,结合实时荧光定量PCR定量分析了水环境中eDNA随时间的降解情况,基于赤池信息准则(Akaike Information Criterion, AIC)选择了最适于eDNA随时间降解的统计模型。实验结果表明:eDNA在水体中的含量与时间呈负相关关系,在eDNA的释放源头被去除后,其在环境中的存留时间为一个月左右。通过本次研究,旨在为合理规划物种的定性检测与定量评估提供理论依据,以期将人为因素造成的实验误差降到最低。
英文摘要:
      Accurate knowledge of species distribution and population dynamics is the basis for conservation biology. However, for certain species with a special life history and populations with very few populations, species distribution detection is extremely difficult. The combination of DNA barcode technology and environmental DNA (eDNA) has solved these difficulties. Currently, this method has been successfully applied to biological testing, biodiversity assessment, biomass assessment, fish migration and other research. Given the ease of degradation of eDNA and its low content in the environment, exploring its persistence in the environment is critical for subsequent accurate qualitative and quantitative analysis. In this study, Fenneropenaeus chinensis was used as the research object. The degradation of eDNA in water environment was quantitatively analyzed by real-time fluorescent quantitative PCR. The relationship between eDNA degradation rate and time was explored. The most suitable eDNA was selected based on AIC. A statistical model of degradation of eDNA over time. The experimental results show that the content of eDNA in water is negatively correlated with time. After the release source of eDNA is removed, its residence time in the environment is about one month. Through this research, the aim is to provide a theoretical basis for the qualitative detection and quantitative assessment of rationally planned species, with a view to minimizing the experimental error caused by human factors.
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