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棕点石斑鱼Piscidin样肽基因的克隆及其成熟肽的原核表达
陈大玮1, 邓利1, 何凡1, 邱聪龄1, 马一见1, 刘志刚2
1.深圳大学生命科学学院;2.深圳大学医学院
摘要:
以简并引物通过RT-PCR从重要经济海水鱼类棕点石斑鱼Epinephelus fuscoguttatus白细胞中扩增出一条388bp具有完整编码框的cDNA序列。Blast分析初步显示,该序列属于鱼类抗菌肽Piscidin家族的一员,将其命名为棕点石斑鱼Piscidin样肽(GU592793),推导氨基酸序列具有界定鱼类Piscidin的以下共同特征:(1)预测的信号肽序列与其他Piscidin的同源性较高,在60%~95%之间;(2)推测的成熟肽N端6个氨基酸残基富含Phe、Ile及His;(3)成熟肽第8个和第13个氨基酸位点均为Gly。NJ进化树分析表明,该cDNA推导的氨基酸序列与赤点石斑鱼Epinephelus akaara piscidin like peptide(ACE78290)、斜带石斑鱼Epinephelus coioides Piscidin-like peptide(ACE78291)以高达81%的支持率聚为一支。也表明本研究成功克隆到棕点石斑鱼首条Piscidin cDNA序列。推测的成熟肽为两亲性阳离子肽,等电点12.48,Schiffer-Edmunson预测其二级结构呈α螺旋构型。将推测的成熟肽序列亚克隆至pET-32a构建融合表达载体pET-32a-pis(EF),并在大肠杆菌E. coli Origami(DE3)中成功表达出融合蛋白,以1mmol/ml IPTG于30℃进行诱导表达,4 h可获得大量表达,目的蛋白以包涵体形式存在。
关键词:  抗菌肽  Piscidin  基因克隆  原核表达  棕点石斑鱼
DOI:
分类号:
基金项目:国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2006AA100308)和广东省大学生创新实验项目(1059010021)共同资助
Abstract:
Key words: